Po Piastovské dynastii Těšínské knížectví přešlo do rukou Habsburků. Těšín vybojoval však status královského města a od roku 1659 měl právo mít své poslance ve slezském sněmu ve Vratislavi. O tato práva však přišel v roce 1722, když Habsburkové darovali knížectví těšínské lotrinskému knížeti Leopoldovi. Jeho syn se později stal manželem císařovny Marie Terezie a jejich potomci (dynastie lotrinských Habsburků) vládli knížectvím a Těšínem do roku 1918. Pravomoci Těšína byly postupně omezovány a na začátku 19. století město bylo formálně a fakticky podrobeno tzv. Těšínské komoře. Období feudální závislosti města od Habsburku přetrvávalo až do roku 1848.
       V 17. a 18. století město prožívalo ekonomickou krizi, kterou způsobila m třicetiletá válka a protireformace, kterou vedli Habsburkové, proto mnozí protestanti museli opustit město. Protestanti své bohoslužby museli konat v skrytosti až do doby, než císař Josef I. povolil v roce 1709 stavbu tzv. milostného kostela.
       V polovině 18. století měl Těšín (bez komorních předměstí) kolem 2 200 obyvatel. Situace se zlepšila až ke konci 18. století. „Císařská cesta“ spojila Těšín s Vídní a s Krakovem a Lvovem, došlo k reformě zdejších škol, v roce 1755 se začaly konat mezinárodní veletrhy. V roce 1779 byl v Těšíně podepsán tzv. těšínský mír, který ukončil válku o bavorské nástupnické právo. Po posledním velkém požáru v roce 1789, byl Těšín velice rychle obnoven a tuto rekonstrukci řídil Leopold Jan Šeršník, nejvýznamnější představitel osvícenství na Těšínském Slezsku. Jeho zásluhou vznikla také v roce 1802 první veřejná knihovna a nejstarší muzeum ve Slezsku a rakouské monarchii.
       Přelom 18. a 19. století patřil k dalšímu těžkému období v dějinách Těšína a to z důvodu válek, které Habsburkové vedli s revoluční Francií, pak s Napoleonem. Bankrot rakouského státu v roce 1811 se dotkl všech obyvatel. Po roce 1815 se začal rozvíjet společenský život, vznikaly první kavárny a spolky. V roce 1837 ve městě žilo skoro 6 000 obyvatel. Další vývoj však omezovala byrokracie absolutistického rakouského státu a feudálního systému.